男科疾病的治疗方法这个问题比较笼统，因为男科疾病有很多的类型，比如前列腺疾病、男性不育症、男性的性功能障碍等，不同的疾病，治疗方法可能不太一样。具体如下：

一、前列腺疾病：

前列腺炎的治疗是以药物治疗为主，也可以配合物理治疗。而前列腺增生是以药物治疗为主，有一部分男性药物治疗效果不好，也可以考虑选择手术。

二、不育症：

1、药物治疗：男性不育症先要去寻找不育症的原因，部分不育症可以通过药物来进行调整，比如弱精、少精，不明原因的可以通过经验性的药物治疗，来提高精子的密度和活力；

2、手术治疗：如果是精索静脉曲张导致的不育症，可以选择进行精索静脉的结扎术，梗阻性无精子症的男性可以考虑进行显微的输精管附睾吻合，非梗阻性无精子症的男性可以考虑显微取精、试管婴儿。所以对于男性不育症的治疗，如果效果不好，都可以选择辅助生殖来进行补救、获得后代。

三、性功能障碍：

男性的性功能障碍一般也是以药物治疗为主，如果是比较严重的情况，比如阳痿药物治疗效果不好，也可以考虑手术，比如阴茎的假体植入术。