毛囊萎缩能否恢复要具体分析，具体如下：

1、脂溢性脱发：毛囊细胞在体内雄激素作用下，逐渐退行性变性、微小化，逐渐萎缩后毛囊不能再长出粗的毛发，只能长出细小毳毛。如果能够早期干预，比如使用抗雄激素阻断剂，阻断雄激素对毛囊的作用，毛囊萎缩能够逆转，甚至恢复。但如果已经到后期，毛囊已经缩小再要逆转较困难，只能通过毛发移植方式才能补救；

2、感染：毛囊萎缩可能由于局部感染因素，比如细菌感染导致毛囊破坏，或者真菌感染引起头癣等，如果能早期进行抗菌、消炎治疗，毛囊如果没有严重破坏，毛囊干细胞还存在则可以再生、恢复。但如果破坏严重，局部可能是永久性瘢痕性脱发；

3、生理改变：毛囊萎缩还有生理性情况，因为毛囊本身就处在生长期、退行期、休止期的周期循环中，经过一段生长期后会生理性萎缩，进入休止期，一般可自然恢复。比如休止期脱发，经过一段时间后，可以重新进入生长期，形成新的毛囊结构。