治疗肠胃不好拉肚子的药物有多种，包括抗生素、止泻药、益生菌等。在使用药物前，最好先咨询医生来根据病因或症状选择合适的药物。具体如下：

1、抗生素：如果肠胃不好拉肚子是由感染性疾病引起的，可以服用抗生素以及对症治疗，常用选择的是头孢类抗生素，成年人还可以选择喹诺酮类抗生素，如环丙沙星、左氧氟沙星等；

2、止泻药：若为功能性腹泻，如肠易激综合征等引起的拉肚子，主要是对症治疗，可以使用蒙脱石散、洛哌丁胺等止泻药；

3、益生菌：可以使用双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等益生菌来调整肠道菌群，若为菌群失调引起的拉肚子，主要是调节肠道菌群平衡，提高肠道免疫力，常用的益生菌有乳酸菌、双歧杆菌、地衣芽孢杆菌、枯草杆菌等，可以改善肠道内环境，缓解腹泻症状。

需要注意的是，药物治疗只是缓解症状的方式，若肠胃不好而拉肚子持续时间较长或反复发作，最好及时就医来找出病因，并进行针对性治疗。