苄星青霉素对梅毒的治愈率，总体而言相对较高，可以达到90%以上，也要具体的分析。不同的梅毒类型，苄星青霉素治愈率也不一样。比如早期没有合并症的梅毒，使用苄星青霉素效果最好，可以达到95%以上的治愈率。
如果是三期的梅毒合并内脏损害，比如心血管梅毒或者神经梅毒，单独使用苄星青霉素可能效果就不太好。比如神经梅毒，苄星青霉素很难穿透血-脑屏障而杀灭脑脊液里面的梅毒螺旋体，所以此时选择水剂青霉素更为合适。
另外使用苄星青霉素，要达到好的效果，使用方法、剂量、疗程、间隔时间都要严格按照治疗指南做，才可能达到高的治愈率。如果治疗不规范，可能导致治疗失败。但总的来讲，梅毒螺旋体对于苄星青霉素还是高度敏感，至今都没有耐药的现象发生。所以苄星青霉素对于梅毒的治愈率，在抗生素当中还是最好的一种。
