医学定义上并没有明确巴氏腺囊肿直径长到多大算是大的囊肿，多小算是小的囊肿。巴氏腺囊肿是否必须切开引流，其实也并没有非常严格的规定。具体如下：
1、不能耐受：如果巴氏腺囊肿较大让病人感受到明显的行动方面不便，比如骑自行车、直立行走、坐位时都会产生身体躯体上不适，这种巴氏腺囊肿就应当予以手术切开引流；
2、能够耐受：如果巴氏腺囊肿较小，或者即使巴氏腺囊肿较大，在3公分、5公分，但是病人自身没有任何的不适的感觉。巴氏腺囊肿也可以在积极坐浴作用之下，促进盆腔血液循环逐渐自己吸收。
但是特殊情况例外，巴氏腺囊肿如果发生继发感染将会导致巴氏腺脓肿，一旦有巴氏腺脓肿的存在，病人将会感受到局部的疼痛。疼痛非常严重，而且局部皮温会明显升高，由于炎症刺激也会导致局部皮肤颜色发红，红、肿、热、痛提示着炎症存在，巴氏腺脓肿治疗还是消炎同时进行切开引流为主。
如果巴氏腺脓肿即使很小1-2公分，给病人带来的疼痛以及躯体不适特别严重必须予以手术治疗。如果单纯巴氏腺囊肿即使长到3-4公分，只要病人没有任何严重疼痛症状可以耐受，手术时机可以等待或者依照病人自身意愿来决定。
