在月经即将干净结束时如果有少许褐色分泌物存在，根据所持续时间有着不同原因。若持续时间较短大约有0.5-1天能够完全结束，是由于月经即将结束时卵巢中卵泡已经开始生长发育并开始分泌雌激素，在激素水平刺激下使子宫内膜得到逐步恢复。

内膜剥脱出血逐渐减少直至完全停止，出血量较少时容易隐藏在宫腔以及阴道内伴有少许铁元素析出，导致颜色变得褐色、深褐色甚至还会变成黑色。若在经期即将结束时，褐色分泌物持续数天才能完全干净，应考虑是黄体萎缩不全。

女性在正常黄体持续功能时，若没有受孕卵巢黄体维持14天后会出现萎缩，会有雌性激素水平下降使子宫内膜出现剥脱出血即正常月经。

但如出现黄体萎缩不全，会在月经期尤其在月经即末期，体内仍存在孕激素水平分泌，导致褐色分泌物存在。针对于不同原因可采取不同治疗方案，如针对黄体萎缩不全，必要时要给予相应黄体补充治疗。