空洞型肺结核相比较于其他类型肺结核，如继发性肺结核，或者没有空洞的浸润型肺结核，治疗较难。大多数空洞型肺结核，尤其是空洞较小，经过早期、足疗程、正规的抗结核治疗，空洞可以闭合，病灶可以吸收，可能仅留下少数纤维增殖病灶。一部分空洞型肺结核，由于空洞周围有结缔组织的增生，以至于抗结核药难以进入空洞内，空洞内的结核杆菌很难被全身抗结核治疗所消灭。上述情况下，空洞比较大，伴有大咯血的患者，必要时在全身抗结核治疗的同时，需要用手术切除的方法，联合全身抗结核治疗，使其临床治愈。

极少部分空洞型的肺结核，由于感染的病灶局部的损伤严重，干酪样坏死组织的痰液排出，局部可以形成多个薄壁或厚壁的空洞，并伴有周围结缔组织的增生。虽然经过比较长时间，如9个月，甚至9个月以上的全身抗结核治疗，空洞内的结核杆菌已经被杀灭，但由于多个空洞，伴有周围纤维结缔组织的增生，以至于形成慢性纤维空洞型肺结核。一旦形成慢性纤维空洞型肺结核，虽然肺结核处于静止状态，患者也不具有排菌的传染性，由于肺功能的损害，会明显地影响患者的生存质量。慢性纤维空洞型肺结核在呼吸功能不全的基础上，继发感染可直接导致呼吸功能不全，可危及患者的生命。慢性纤维空洞型肺结核的患者也可以由于损伤血管，出现大咯血，从而危及患者的生命。

因此，大多数空洞型肺结核，经过正规的足疗程抗结核治疗，可以达到临床治愈空洞闭合。但不排除少数患者需要接受手术切除，以及极少数患者会留下慢性纤维空洞型肺结核的后遗症。