耳后根一阵一阵疼需要考虑以下几点原因：

1、耳大神经痛：在一般情况下，枕神经、耳后神经部位容易产生病毒潜伏，在劳累、疲劳时，免疫力下降，会出现耳后神经或枕大神经疼痛，此时需要考虑是病毒感染引起的神经痛；

一方面需要增强免疫力，注意休息，不要劳累、疲劳，少看电视、电脑、手机，增加营养等，增强免疫力，对症治疗。较轻的疼痛可以给予对症治疗，止痛药包括芬必得(布洛芬缓释胶囊)、散列通(复方对乙酰氨基酚片)，可以改善症状，还有加巴喷丁也可以改善神经痛的症状；

2、偏头痛：偏头痛的发生也是在劳累后，或者女性的生理期，进食奶酪、咖啡、芹菜、腌肉、红酒等情况下，容易出现发作，会表现为一阵一阵的搏动性疼痛。如果考虑偏头痛，需要去除诱因，以上食物尽可能不要进食，注意休息，发作时对症治疗，可以有所改善。如果频繁发作，平时可以使用西比灵(盐酸氟桂利嗪胶囊)改善症状；

3、紧张性头痛：呈一侧疼痛，也会出现一阵一阵的疼痛。一般与压力太大、精神疲劳有关，会造成头皮肌肉收缩，出现耳后的肌肉收缩导致一抖一抖的疼痛。需要去除病因，注意休息，改善精神压力造成的肌肉收缩症状，也是以对症治疗为主；

4、颅内疾病：属于比较严重的原因，包括脑梗塞、脑出血、颅内感染等，也会造成一阵一阵疼痛。因为此种病变只要牵拉到或者刺激到以上神经，都会引起类似的疼痛。需要进行头颅检查来明确诊断，进行相应的治疗。