宫颈活检后腹痛原因包括以下几点：

1、由于阴道镜检查需应用扩阴器撑开阴道壁较长时间，使阴道壁与宫颈暴露在空气中较长时间，从而导致阴道壁水肿甚至充血，并造成不适感；

2、活检存在伤口，此时可导致腹部轻微疼痛，属于正常现象，无需过多担心。但如果疼痛持续加重或持续时间长需引起注意，需要明确活检部位是否发生炎症，并导致炎症加重而引起急性炎症，此时患者需及时就医。