碘伏主要用于消毒，对细菌等病原微生物有杀死、抑制的作用，所以有消炎作用。但是大众所理解的消炎与专业上的消炎不同，大众认为炎症皆由细菌等病原微生物引起，一般认为使用消炎药是用于杀灭细菌。

专业上的消炎，炎症不但可由细菌等病原微生物引起，烧伤、创伤等也可造成炎症，所以使用碘伏的目的是消毒，主要是预防切口周围细菌入侵切口。如果切口有炎症，不能将碘伏直接倒在感染发炎的切口中，否则可引起切口疼痛。切口周围炎症如果有感染，主要时进行引流、冲洗，从而使机体免疫白细胞杀灭、消除炎症因子、脓细胞、细菌等。