双歧杆菌的制剂主要用于调节胃肠道的菌群，临床上使用的双歧杆菌制剂包括双歧杆菌三联或四联的活菌制剂。通常建议患者餐后服用双歧杆菌的活菌制剂，可以用温开水或牛奶送服。此药物能够在胃肠道直接发挥作用，起到抑制有害菌生长的功效，能够调节胃肠道菌群，促进胃肠道有益菌的生长及繁殖。
因此在临床上，此药物可以用于菌群失调所导致的便秘、腹泻，以及功能性的消化不良。由于双歧杆菌的制剂属于活菌制剂，存放时要避免高温，并且在服用时，也不能与抗菌药物同时服用，如果确实需要服用这两种药物，最好间隔两小时以上。同时使用双歧杆菌活菌制剂时，也应该避免与铋剂、鞣酸，以及其他具有吸附作用的药品同时使用。
