宝宝做头CT有可能对宝宝有影响，临床的检查常具有两面性，尤其是CT检查。CT检查具有一定的放射性损伤，所以有可能对宝宝有一定的影响。但是如果根据宝宝的临床的病情判断，医生权衡利弊觉得宝宝需要做CT检查来明确诊断，建议家长应当积极配合医生完善检查。

对于某些疾病，尤其是颅脑外伤，当宝宝有颅脑外伤，怀疑有颅内出血的时候，临床建议应当遵从医嘱去做头部CT的检查，因为用头部CT来判断是否有颅内出血相对比较准确。

如果因为拒绝应用头部CT，害怕、担心其副作用拒绝检查，影响医生对宝宝疾病的判断，对宝宝造成的危害可能会更大。所以任何一项检查会通过医生的权衡利弊，对宝宝有利的，会建议遵从医生的医嘱去完善检查。

当然如果是做头部的其他方面，比如要检查是否患有脑肿瘤、脑血管疾病，可以不选择头部CT，选择头部核磁，看得可能会更加清楚，判断更加准确。