大肠癌放疗的副作用，其实与化疗副作用有相同之处，放疗特殊局部反应的副作用是最常见的为骨髓抑制，骨髓抑制血细胞的减少包括白细胞减少、中性粒细胞减少、血小板的减少等。

部分患者出现恶心、呕吐的症状，出现局部反应如皮肤放射性皮炎，还有可能出现放射性肠炎，放射性肠炎表现腹泻、腹痛等症状，盆腔放疗可能出现生殖功能、性功能的影响。