肛门直肠脓肿早期的症状是疼痛，疼痛有时候很厉害，疼痛难忍；肛门发现炎性的包块，再严重一点，可能会发生发热、白细胞增高等症状。一般发现肛门周围有炎性包块，即可诊断是肛门脓肿。
如果是在早期，通过用手触摸看肛门脓肿周围的包块有没有形成脓肿，或者通过B超看腔内有没有形成液体的情况。如果脓肿还没有形成、硬块还比较硬的情况下，这时候的治疗主要是靠消炎，可以口服抗消炎药或者静脉输消炎药。
有些病人在这期间可能就会达到缓解，炎症逐渐消退，并没有形成脓肿。但是如果发现有脓肿已经形成，在消炎治疗的同时，还可以考虑将脓肿切开引流，因为脓肿形成的时候，病人的疼痛可能很严重，如果靠自己溃破，排出脓液也可以好转。
但是此时如果将脓肿切开引流，病人可以立刻解除疼痛，脓肿的治疗时间也能够提早。
