致病的支原体中，肺炎支原体可以引起肺炎，人型支原体、解脲支原体和生殖支原体主要引起泌尿生殖道的感染。衣原体感染是各种衣原体感染所引起的一组感染性疾病，可以导致子宫感染、早产、流产、尿道感染、肺炎、支气管炎、胃肠炎、脑脊髓炎、结膜炎、关节炎等多种疾病。
衣原体感染也是一种常见的性传播疾病，对衣原体感染有效的药物对支原体的感染也有效。必要时可以采用四环素类药物进行治疗，比如常用的有多西环素、米诺环素。还有就是大环内酯类的药物，比如红霉素、罗红霉素、阿奇霉素、克林霉素、克拉霉素等。
还有就是喹诺酮类的药物，有氧氟沙星、左氧氟沙星等。上述这些药物可以用来治疗生殖支原体的感染，疗程一般是1-2周。
红霉素对人型支原体无效，而克林霉素对解脲支原体无效，因此在发现是这两种支原体感染的时候，一定要避免使用这两种药物。
