女性小便时腹部疼痛，常见的原因有膀胱炎、膀胱过度活动症、胃肠炎等，具体如下：

1、膀胱炎：膀胱炎在女性中较为常见，因为女性尿道外口毗邻阴道和肛门，周边的细菌，如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌容易沿着尿道外口入侵，造成女性膀胱黏膜充血、水肿，导致膀胱发炎。膀胱是储存尿液的器官，如果是已经肿胀、溃疡的黏膜，再剧烈收缩排出尿液，会造成女性膀胱区疼痛，膀胱区位于小腹上方，需做尿常规检查排除有无膀胱炎的可能；

2、膀胱过度活动症：膀胱过度活动症有多种原因，如膀胱结石异物、结石性膀胱炎等，可能扰乱整个膀胱内容量感受器，患者会经常出现尿急甚至急迫性尿失禁、夜尿以及尿频，有时也会造成膀胱区疼痛。必要时可以先尝试使用M受体阻断剂，如托特罗定。另一方面也可直接做膀胱镜，明确内部情况；

3、胃肠炎：女性小便时出现腹部疼痛，如果出现了腹泻，也要警惕胃肠炎的可能。