真菌性脑膜炎是指真菌感染到脑膜以后，引起中枢神经系统感染，有时可继续累及脑实质，引起真菌性脑膜脑炎，本病确诊的方法如下：
1、进行神经科的专科查体：真菌脑膜炎的症状可以表现为感染征象，包括发热、头痛、恶心、呕吐，在查体时可以看到颈项强直、克氏征阳性等脑膜刺激征的情况。如果病变累及到脑实质，可以出现局灶性神经功能缺损的表现，比如肢体瘫痪、颅底改变、视物模糊、面神经瘫痪、三叉神经痛、者面瘫及耳鸣、眩晕、听力下降等，通过相应的神经科专科查体，可以发现一些异常；
2、影像学的检查：如磁共振，可以发现脑膜强化、脑水肿、脑积水的情况，或者发现局灶性的病灶；
3、腰穿脑脊液进行化验：对隐球菌墨染色或隐球菌的真菌培养，以达到确诊目的；
4、隐球菌荚膜抗原检测：目前也可以根据隐球菌荚膜抗原检测结果来判断，如果抗体阳性，也可确诊为真菌性脑膜炎。
