如果是消化道肿瘤，如胃癌、肠癌，磁共振检查可能比胃镜、肠镜检查效果稍差。磁共振也称磁共振成像、MRI，是临床上通过磁共振显像应用于临床检查人体组织结构，观察是否有异常组织结构成分存在。磁共振成像可以用于身体多个部位，如四肢、躯干、头部、颈部，对于实质性肿块敏感度较高，准确性较高，如肝脏、肾脏的肿块，用磁共振检查比较容易做出精准判断。
磁共振成像没有射线，因为其利用磁共振的方式进行成像，CT检查有X射线，磁共振对人体危害更小，磁共振成像信息量较大，能够帮助诊断的信息比较多，更有助于做出精准判断。磁共振除能够用在诊断，还能用在治疗效果的判定，如在治疗前做磁共振扫描，在治疗以后再重复做磁共振扫描，观察肿块是否被杀死，活性是否减弱、缩小。
