肝内胆管结石变大速度存在非常大的差异，有许多患者可能经过很多年也没有明显增长，也有少数患者可能会增长得很快。影响肝内胆管结石变大的因素，主要包括局部胆管的狭窄因素，还有患者胆汁的成分异常以及治疗因素。
如果患者局部存在明确的胆管狭窄，胆汁容易在此淤滞，此种情况的结石就会增长得比较快，尤其是当合并反复感染的时候，结石就会更快增长。在Oddi括约肌切开后或Oddi括约肌相对比较松弛的患者，容易反复发生肠内容物向肝内胆道反流、肠内细菌向胆道内入侵，此时结石的发展速度会明显增加。
另外，治疗也会对结石造成一定影响，通过应用熊去氧胆酸、复方阿嗪米特等药物，可以起到一定刺激胆汁分泌、溶石的效果，也可能延缓肝内胆管结石的进展。
