药物流产和无痛人工流产两种方式各有利弊。如果药物流产能够成功，对女性的身体损伤，尤其对子宫内膜的损伤会相对小一些，因为没有金属器械在宫腔内搔刮和操作。但药物流产有一定的适应症和禁忌症，对于青光眼、哮喘及肝肾功能异常的女性，不能进行药物流产。另外，药物流产还有一定的失败率，它的成功率并没有人工流产高，一般在80%-90%，大约有10%的女性进行药物流产可能会失败，此时仍然需进行人工流产的清宫手术。
人工流产后胚胎组织的排出比较彻底，但对女性的子宫内膜损伤相对较大，尤其在手术过程中，可能会造成子宫穿孔、继发感染等。所以选择何种流产方式，需要根据女性的具体情况判断。一般对于停经天数比较短的女性，可以选择药物流产，而对于停经天数较长的女性，一般选择人工流产。
