肛门常见的疾病，通常归肛肠科治疗，部分医院没有开展肛肠专科、肛肠科，通常会归在普外中心，可以到正规医院的普外科就诊。肛肠科常见的疾病，包括痔疮、肛裂、肛周脓肿和肛瘘，其中肛周疾病还包括结、直肠息肉、肿瘤以及炎症。
若患者出现肛门周围的异常包块、肛周反复便血，出现脱出、肿痛、瘙痒、流脓等以前未出现过的情况，或有结、直肠肿瘤家族史，又出现消瘦、乏力等情况，需要到肛肠科就诊，做电子结肠镜，以排除结、直肠的异常情况。若患者出现肛门坠胀、肛门瘙痒、骶尾部的肿胀、不适，也有可能为肛肠科疾病，如肛瘘或藏毛窦，亦要到肛肠科就诊。
