红眼病治疗主要针对不同病因治疗，感染性要针对感染治疗，非感染性要用不同方法治疗。感染有细菌感染、病毒感染、衣原体感染，针对不同感染用不同药物，细菌感染主要用抗生素，病毒感染用抗病毒药物，沙眼衣原体用红霉素族、氯霉素族等药物，病因不同使用的药物不一样，在治疗结膜炎时，还会辅助用药，比如优质的人工泪液等保护角膜的药物。对于非感染性结膜炎，针对干眼治疗用润滑保护的药物，针对过敏用抗过敏药物，因全身性疾病引起的结膜炎，如睑缘炎引起或者全身免疫性疾病引起的结膜炎，治疗眼部病变的同时还需要治疗全身性疾病，除眼部、局部用药外，还要全身用药，眼部局部用药包括眼药水、眼药膏这类。
如果分泌物特别多，会利用冲洗把分泌物冲洗出去。一般眼药水白天使用，眼药膏夜晚使用，因为眼药水作用时间比较短，使用次数较多，而眼药膏作用时间比较长，睡觉前涂眼药膏后，一夜都有药效。红眼病病因不同用药也不一样，要在医生指导下，根据不同病因使用不同药物，药物的使用次数、方法等也要在医生指导下使用。
