移植当天出血大部分是因为宫颈因素，而不是排斥胚胎。移植当天胚胎还未着床，通常在移植时用生理盐水将阴道擦洗干净，然后用带有培养液的小棉棒在宫颈处进一步擦洗。少数人的宫颈交界区比较脆弱，所以在擦洗过程中可能会导致少量出血。
放置移植管时含有内芯且内芯较硬，如果病人的子宫弯曲度比较明显，可能在过宫颈的过程中会触碰到子宫而出现少量出血，但不是宫腔内出血。多数病人在移植之后，可能回家时会发现有少量出血，而认为是胚胎掉落，但是这种出血不会对怀孕造成较大影响。排斥胚胎还未发生，这种出血可能是在过宫颈时造成的出血，出血量较小，第二天可能消失，所以没有太大影响。
