腹泻后发热原因通常提示细菌感染并没有受到控制，腹泻可以由多种原因导致，常见原因是进食不洁饮食，由细菌感染食物导致急性感染，出现细菌感染性腹泻。如果只是单纯止泻治疗，有可能大便次数减少，但是却出现发热，因为腹泻过程也可能把有害细菌排出，如果只是单纯缓解腹泻，有害细菌不容易被排出，反而入血后导致全身症状，比如发热。

明确是细菌感染性腹泻后要注意休息，还需要抗感染治疗，抗生素治疗对腹泻缓解有效，常用抗生素包括盐酸小檗碱，即黄连素。如果这类药物效果不好，可以选用喹诺酮类药物或第三代头孢菌素等，对于细菌性腹泻有好处，所以有效对因治疗才能更好治疗疾病。