慢性肾脏病导致尿毒症一般治不好，部分急性肾损伤可恢复，尿毒症只是肾功能衰竭一个分期。如果各种病因导致慢性肾脏病，肾脏逐渐萎缩，最终功能会逐渐衰竭到尿毒症，内科无法治疗。治疗主要是通过肾脏替代治疗方法，即血液透析、腹膜透析。血液透析通俗讲叫人工肾，是目前广泛应用尿毒症治疗方法之一，将患者血液与透析液同时引入透析器，清除血液中尿毒症的毒素及体内多余水分。
腹膜透析应用人体腹膜作为透析膜进行血液净化，将透析液引入患者腹腔，血液中毒素与水分通过腹膜进入腹腔中透析液，然后排出体内。肾移植是将来自供体肾脏通过手术植入受体体内，从而恢复肾脏功能。血液透析与腹膜透析只能部分替代肾脏功能，所以有其不足，最好办法是肾移植。如果因某些疾病引起急性肾功能衰竭，如严重失血、血容量不足、输尿管梗阻及急性肾脏疾病，比如化疗引起急性小管坏死等。通过纠正病因，及时有效治疗，绝大多数患者肾功能可恢复正常或者部分恢复。