冬虫夏草在治疗肾病方面有一定的优势，目前临床上应用的制剂较多，如百令胶囊、百令片、金水宝片等，可以改善肾脏肾小球基底膜的通透性，使损伤受到修复。而且机械屏障和电荷屏障同样得到修复，使漏出的蛋白和红细胞减少。
同时冬虫夏草制剂可以抑制系膜细胞增殖，抑制系膜基质沉积，减少肾脏病的进展。同时提高机体的抵抗力，纠正免疫失衡而出现的免疫性肾小球病变。
但是冬虫夏草制剂单独应用于治疗肾病的时候，效果可能不是很理想，尽管具有效果，只能单独应用于很轻的肾炎，如隐匿性肾炎，或者少量蛋白尿，即尿蛋白＜1g/24h。
如果尿蛋白＞1g/24h，必须联合其它药物进行治疗，如血管紧张素转换酶抑制剂、血管紧张素受体拮抗剂，以及对症治疗，包括降低血压、血脂、血糖，使肾脏疾病得到完全康复或者明显好转。不管是原发性肾脏疾病，还是继发性肾脏疾病，治疗原则一样。
