小孩阴茎肿痛，可能是以下原因引起：

1、局部感染：对于小孩阴茎肿痛，在门诊经常见这些小孩，小孩来了后通过查体发现，小孩阴茎头包皮处可见红肿，同时严重的可以看到少量的脓性分泌物，这时大部分小孩一般都是包皮龟头炎。通常都是因为小孩包皮过长或者包茎，因为有局部感染，造成小孩阴茎肿痛；

2、外伤：也有比较少见的情况，如小孩因为外伤，因为骑自行车或者骑木马，小孩阴茎受到挤压后局部肿胀、疼痛；

3、异物刺激：部分小孩调皮，把一些异物，如小钢珠、小树叶塞到尿道口里，可能会引起肿痛。

所以，小孩阴茎肿痛最常见的还是感染，少见的是外伤或者其他异物刺激。因此碰见这种情况要仔细查体，明确小孩阴茎头肿痛的同时有无合并红肿、脓性分泌物，如果有脓性分泌物，大部分原因是尿路感染，最主要的原因还是包皮过长或者包茎，在局部感染因素增加后引起的感染。

这种小孩多喝水、多排尿，让尿液起到冲刷作用，一般2-3天，长的情况下3-4天，可能逐渐症状会改善、痊愈。如果反复出现这种情况，可能需要做包皮环切手术，把局部感染的异物去掉，一般小孩的阴茎肿痛会逐渐消失。