男性结扎后对男性有伤害，而且伤害比较大。人体在胚胎发育的过程中，免疫细胞对于先天自身的蛋白质有一个识别过程，在胚胎发育过程中免疫细胞接触过、遇到过的蛋白质，都认为是一种自身的抗原，但是生殖系统例外。生殖系统在整个胚胎发育过程中，都受限于血睾屏障的保护和包裹，很多蛋白质不能与免疫细胞相遇，很容易被免疫细胞识别为外来的蛋白质、识别为异样的抗原。所以男性一旦做结扎，尤其是输精管结扎以后，很容易导致男性生殖系统内部的精子潴留、张力过高、血睾屏障破裂。
血睾屏障破裂以后，男性的精子就会反渗进入循环系统，此时碰见免疫细胞，就会被免疫细胞识别为外来的蛋白质，识别为异种抗原，此时就会产生一系列的自身免疫系统疾病，对于男性免疫系统的健康有着很大影响和危害。所以男性的输精管结扎从90年代以后，在临床上基本上被淘汰，节育的手段更多是从女性的角度入手。
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