卵巢巧克力囊肿可以保守治疗，但需要具备一定的条件，具体如下：
1、囊肿的直径不超过4厘米：若囊肿的直径不超过4厘米可考虑保守治疗。保守治疗即使用非手术的方法治疗，此时可口服地诺孕素片，也可用中医、中药的治疗方法，但要定期复查；
2、囊肿明显缩小：在临床上若囊肿明显缩小，并且接近于更年期的情况或接近于绝经的情况，此时也可给予保守治疗，建议病人动态观察。
若囊肿相对较大而且病人希望怀孕，或有囊肿蒂扭转、破裂的可能性。此时要尽快考虑急性手术治疗。此外，在手术治疗后还需继续用药，主要是用抑制子宫内膜生长、预防巧克力囊肿复发的药物，且在治疗后仍要定期到医院检查。
