腺样体和扁桃体，均属于淋巴上皮组织，在人体起到重要的防御作用，是人体重要的淋巴器官。因此临床割除腺样体或扁桃体，需要权衡利弊，尤其是儿童免疫系统发育尚未成熟时，刮除腺样体或摘除扁桃体，可能造成机体免疫力下降。此时外界的病原体可以直接进入体内，再进入呼吸道，而引起气管及肺部感染，同时可能干扰整个免疫系统，因此要尽量保守治疗。
腺样体位于鼻咽部，由于慢性炎症刺激，可以增生、肿大而使气道受压迫、阻塞，患者出现睡眠打鼾、张口呼吸、耳部并发症或腺样体面容时，属于手术刮除指征。扁桃体过度肥大造成患者张口呼吸、吞咽困难、讲话含水音，或扁桃体炎反复发作形成病灶时，可以引起全身并发症，此时应进行手术摘除，手术前应慎重分析患者的全面情况。
