如果只是单纯经过实验室检查发现HPV68型阳性，没有其他病变，到目前为止没有哪一种药物对这种HPV有治疗效果。通常经过1年左右的时间，HPV68型阳性大约80%会自行转为阴性，只有20%左右的人会发生持续性感染。
对于持续性感染，也没有好的药物进行治疗，只是定期地给予复查。如果通过复查发现在高危HPV感染下，宫颈上皮发生了低级别癌前病变，可以考虑做激光治疗或者冷冻治疗。主要是使病变组织坏死、脱落，再长出新组织，就达到了治愈的目的。
如果已经发生高级别癌前病变，则建议做宫颈局部锥形切除手术来进行治疗，也能达到治愈的目的。所以单纯的HPV68型阳性不用给予治疗，只要定期复查，发生病变再进行处理。并且也建议一旦HPV68型阳性转为阴性，可以考虑接种HPV疫苗。
