一侧扁桃体疼痛连着耳朵疼，有可能是以下几种情况：

1、当急性咽喉炎发作时，检查咽腔黏膜会出现充血，会有一侧的咽腔或者一侧的扁桃体处出现疼痛，一般如果出现咽部疼痛，会放射到同侧的耳朵出现疼痛；

2、当急性扁桃体炎发作时合并了急性中耳炎，出现耳膜充血，也会出现一侧的扁桃体炎症，并且合并有急性中耳炎发作；

3、当抵抗力下降时，如果急性扁桃体炎发作，并且症状没有得到及时地控制，出现了同侧的扁桃体周围炎或者扁桃体周围脓肿，会引起同侧的耳部出现疼痛；

4、当出现扁桃体发炎时，由于神经反射，也可以牵连到同侧的耳朵。

所以当出现扁桃体疼痛、耳朵疼痛时，需要先检查咽腔，检查是否是扁桃体炎或者扁桃体周围炎。另外，需要检查耳部是否合并了急性中耳炎，明确病因，对症治疗。