患者在坚持用药的情况下，能够恢复正常且无症状，称为临床治愈。双相情感障碍属于一种慢性的、容易复发的疾病，需长期治疗。若患者症状稍微好转马上停药，复发的风险较高。因此患者需遵循全病程治疗的原则，但并非终身服药。
全病程原则可分为三个阶段，急性期大概需要2个月左右，目的是快速控制症状，从而恢复较好的社会功能。巩固期需要3-6个月，主要是预防患者症状的反复，即预防复发，患者在此期间可辅助心理治疗。
维持阶段主要是预防复发，指南普遍推荐2-3年或2-3个循环周期。患者在维持期药物剂量可适当减少，中间可增加康复训练，可有长疗程的心理治疗。双相情感障碍属于发作性疾病，患者在发作间歇期，社会功能可恢复正常，可保持较好的生活、工作能力，可过正常生活。
