肠球菌感染多是革兰氏阳性菌感染，多选用青霉素族或者头孢类抗菌素杀菌消炎。中药多用清热化湿的药物进行治疗，比如黄芪、黄连、黄柏等，也可以考虑葛根芩连丸、枫蓼肠胃康等清热化湿的中成药进行治疗。

临床上湿热阻滞的病人主要表现为大便稀溏、舌红、苔黄腻、脉弦滑数，有便前腹痛、便后缓解，大便常规可以看到白细胞，血常规可以看到白细胞增高、中性粒细胞比较偏高。如果有泌尿系感染或者肠道感染，可能会查出肠球菌。因为肠球菌属于革兰氏阳性菌，所以多用青霉素族的或者头孢一代进行治疗。