胃镜全麻常用的无痛是用注射方法，在全麻过程中常规建立一个外周通脉，从外周通路注入镇静药和镇痛药。麻醉过程中常用的镇痛药是芬太尼、瑞芬太尼、舒芬太尼、阿芬太尼这类弱阿片类药物，镇静药常用丙泊酚、依托咪酯、环泊酚这类镇静药，用镇痛镇静的方法保留呼吸，不气管插管。
此时胃肠镜医师可以给病人进行诊断、早癌筛查或活检及简单治疗，病人在熟睡状态下没有痛苦，内科医师在检查过程中也能更从容、仔细、全面，一般全麻是用注射方法，不用吸入方法。
有些医院可能也存在吸入方法，如笑气，即氧化亚氮，但是多数医院、地区都是用注射方法，即静脉镇痛、镇静的方法来做无痛胃肠镜的检查、诊疗或者活检去除。
