超声是肾结石首选的一种检查方法，典型的肾结石在超声检查中可发现，在肾窦中有团状、较亮的回声，后方通常伴有声影，若加上彩色，则会出现快速的闪烁伪像，这种超声表现有助于超声医生诊断肾结石。

如果结石长在肾盂、输尿管连接部位，会出现肾盂积水，检查中可见结石卡住，尿液无法排出而导致梗阻，进而形成积水。若结石往下掉落到输尿管或其他部位，也会出现积水，此时患者会感觉到疼痛，医生也可以根据疼痛部位，查找结石部位。