新生儿心脏有杂音最主要提示其心脏存在先天性心脏病的可能。因为新生儿心脏有杂音提示心脏里有异常管道或者是相对狭窄的部位，使血流产生了湍流，所以听诊听到杂音，所以高度提示先天性心脏病的可能。

根据杂音的性质和部位不同，可能提示的先天性心脏病类型不一样。如胸骨左缘3-4肋间的3级反流性杂音，提示室间隔缺损。如果是胸骨左缘2-3肋间的喷射性杂音，可能提示肺动脉狭窄。

如果是一个胸骨左缘2-3肋间的连续杂音，提示动脉导管未闭。所以新生儿的心脏杂音部位和性质对先天性心脏病的类型也具有一定的判断。

当然还有一部分新生儿心脏杂音也可能是生理性，最常见的是胸骨左缘2-3肋间的心脏杂音，往往是程度2级左右的喷射性杂音，这主要是由于肺动脉相对狭窄所引起，因为在胎儿时期肺血流很少，

出生以后肺血流显著增加，肺血管相对窄所产生的杂音。区分是病理性杂音还是生理性杂音必须得做一个检查叫超声心动图，而不能单纯地通过听诊来做出决断。

超声心动图能够对有杂音的90%以上的先天性心脏病新生儿做出一个明确诊断，所以新生儿如果心脏有杂音，怀疑有先天性心脏病，一定要做一个超声心动图检查，来进一步判断心脏结构有无异常或者是异常类型。