根治扁桃体总发炎，有两种办法，一种是药物根治，一种是手术根治。

1、药物根治：孩子的扁桃体发炎以溶血性链球菌感染引起的感染比较常见，一般可以选择敏感的抗生素进行抗炎治疗，如果用到足够的疗程、剂量，孩子扁桃体发炎可以被控制；

2、手术根治：还有一种孩子需要进行手术的办法进行根治，手术的治疗的适应证是一些反复出现扁桃体发炎，1年之内超过4-6次的发炎，同时孩子可能会出现扁桃体的周围脓肿，这个时候可以考虑给孩子进行扁桃体手术进行根治。在有些孩子的扁桃体反复发炎以后，引起扁桃体肿大，影响呼吸和吞咽，也可以考虑进行手术根治。还有一些孩子本身就有一些基础疾病，像孩子有肾炎或者风湿热，这个时候孩子如果经常扁桃体发炎，可以考虑进行手术根治。

但是扁桃体本身是人体的免疫器官，当外界病毒和细菌进入体内的时候，扁桃体有一个对外界的病毒细菌的免疫反应，所以如果轻易把扁桃体摘除，可能会影响孩子以后的疾病的状态。

如果孩子外界的病毒、细菌进入体内，有可能直接进入气管或者肺部，引起支气管炎或肺炎，所以根治扁桃体发炎，首选的还是进行药物的治疗。确实存在一些适应证的情况下，可以考虑进行手术根治。