急性扁桃体炎，特别是急性化脓性扁桃体炎，如果没有得到正确、及时的治疗，会形成慢性化脓性扁桃体炎，病程通常在3个月以上。这种情况要进行抗炎治疗，采用药物治疗，包括全身使用抗生素，例如头孢类、大环内酯类以及喹诺酮类抗生素。同时可以给予全身化痰的药物治疗，如局部使用雾化吸入治疗，以及口含片、喷雾剂。
在饮食上，应注意避免辛辣刺激性食物，保证清淡饮食，可以多吃蔬菜、水果，尽量多饮水。另外应避免接触有毒、有害，以及刺激性气味，并且避免吸烟、饮酒，才能保证扁桃体炎尽早恢复。如果反复发作会导致全身并发症，或者每年发作超过3次，每次均伴有全身发热等症状，建议采取手术切除，以治疗慢性化脓性扁桃体炎。
