意外怀孕一般在怀孕7周左右进行流产比较合适，此时的胚胎大小较为合适，进行超声检查时很容易发现，手术当中也不容易漏刮。除手术以外，还可以选择进行药物流产，而药流、手术流产也各有利弊。药流首先对子宫内膜的损伤很小，只是会造成子宫内膜脱落，而这种脱落则是自发性脱落，因此不会损伤子宫内膜。除非在流产之后发生感染，则可能会造成子宫内膜炎。但药流所需的时间会比较长，需要服用两种药物，可能需要几个小时才能够将胚胎排出。而且在排出的过程当中会造成子宫剧烈收缩，疼痛也会比较严重。
此外药流还需要了解胚胎是否完整排出，如果排出的胚胎大小与超声提示的大小存在明显差别，则可能提示药流失败，这时还需要进行人流。现在很多人流都可以在麻醉下完成，因此并没有明显的不适，疼痛时间和程度均较为轻微，所以影响相对较小。但是人流本身是一种手术操作，对于子宫内膜可能会造成损伤，这种损伤甚至难以修复，并且对将来生育甚至会造成不可逆的影响。
