胆汁由肝脏合成，经由各级胆管排泄，最终进入到肠道。空腹的时候，胆汁在胆囊内储存和浓缩，进食的时候胆囊收缩，胆汁进入到胆总管，最终流入到十二指肠。所以正常人胆汁是在肝脏合成，而不是胆管合成，胆管主要是用于运输胆汁的管道结构。

胆囊可以作为胆汁的临时储存场所，胆囊还可以将每天肝脏合成的800-1000mL胆汁，浓缩成为一天大概200-300mL的胆汁。进食的时候胆囊收缩，胆汁进入到肠道，以提高胆汁对于脂肪的乳化、消化的能力。

任何的胆道疾病，包括胆管的结石、胆管的炎性狭窄或肿瘤、胆管内的异物，都可能会干扰到胆汁的正常流动和排泄，引起胆道梗阻。而某些自身免疫性疾病，部分小的胆管炎或者药物，也会引起肝内小胆管的胆汁淤积，称为肝内胆汁淤积，会出现黄疸等。