硅酮凝胶祛疤的效果取决于使用的时间和针对的瘢痕，通常对于新的瘢痕效果较好，对于陈旧性瘢痕效果差强人意。从硅酮凝胶发挥作用的原理进行分析，硅酮凝胶祛疤的作用不是硅酮本身，而是因为硅酮凝胶形成了一个封闭的水合、湿润环境，使瘢痕中的成纤维细胞、纤维细胞和胶原得到部分改善，使部分瘢痕的胶原恢复正常的解剖排列层次，从而减少瘢痕形成与增生。
使用硅酮凝胶抑制瘢痕增生也是常用的第一手段，对于新的瘢痕，通常在伤口愈合后5-7天使用硅酮凝胶，3个月左右可以较好地抑制瘢痕进一步增生。但对于陈旧型的瘢痕，即超过半年的瘢痕，再使用硅酮凝胶时，作用较小。而当瘢痕增生已经形成增生性瘢痕或瘢痕疙瘩时，再单一使用水合作用的封闭药物进行缓解，效果也非常有限。所以虽然部分硅酮凝胶可起到抑制瘙痒的作用，但总体对于瘢痕的治疗效果非常有限。
