药物流产使用的药物都是短期的效果，没有明显毒副作用，但如果流产的过程不顺利，没有流干净、流血时间过长，或者需要二次清宫，有可能会对女性造成危害。

危害就是胚胎流产不全需要清宫，清宫可能会引起子宫破裂穿孔，或者损伤子宫内膜还有流产不全、流血过多造成大出血，或者盆腔的感染。建议平时注意避孕，避免流产。若需要药物流产，建议选对合适的医院，注意适应证，流产过程注意监护，避免出现不良危害。