肾窦内的结石不容易排出来，主要与结石在肾窦内有关，肾窦与肾盏没有较好的通道，不可能顺利进入肾盏内，再进入肾盂内，通过输尿管排到膀胱，通过尿道排出体外。如果肾窦内结石没有引起明显的积水，没有影响肾脏的功能，可以考虑观察、等待为主。平时需要多喝水，可以形成更多的尿，有预防作用、排石作用。
如果肾窦内结石引起局部积水，此时可以考虑做经皮肾镜手术，通过手术的方式将肾窦内结石击碎，再冲洗出。并且可以找到细小的通道，将通道扩展开，肾窦内的结石就可能进入肾盏内。如果肾窦内结石较小，通常也不会引起疼痛、血尿、恶心、呕吐等，建议每3个月复查一次B超，如果没有影响肾脏功能，即可一直观察等待。
