非淋病性尿道炎一般急性的最为多见，如果是慢性非淋病性尿道炎，容易引起尿道狭窄，可以治疗，但是并发症有些人治疗非常困难。如果是十几年反复发作的慢性非淋病性尿道炎，或者治疗好后又出现非淋病性尿道炎，是急性非淋病性尿道炎反复出现，这两种情况治疗方法不一样。
急性反复感染引起的非淋病性尿道炎，通常用药半个月后症状消失，检测没有衣原体和支原体感染就算痊愈。预防非淋病性尿道炎再感染，性生活要带避孕套，或者检查配偶是否有感染。
如果是十几年的慢性非淋病性尿道炎，会出现尿道狭窄，纤维组织增生，治疗起来较困难。除了治疗细菌外，还要进行尿道扩张，通过长期治疗能治好非淋病性尿道炎。
