肾脏结石目前的手术方式有很多，并发症主要包括血尿、感染等。因为结石位于肾脏内，在碎石过程中难免对肾脏黏膜造成损伤，手术后会出现血尿的情况，少量血尿是正常现象，黏膜会自行愈合，不需要通过治疗。同时还需要观察血尿的颜色及量，如果是淡血性，不需要治疗，能够愈合，如果是持续的大量血尿需要通过止血的手段进行处理。但开放手术基本已经不使用，通常使用的是微创手术方式，包括输尿管软镜碎石，腹腔镜切开取石及经皮肾镜碎石取石术。
另外，结石通常会伴发感染，手术过程中有可能因为压力等各种原因，让尿液中的细菌进入到血液，或因为手术以后患者免疫力下降，继发形成的感染，表现为高热，严重者会引起血压降低，这时需要通过抗炎治疗降低风险。
