婴儿的阴茎短小，在临床中最常见的两种情况。

1、小阴茎：用手触摸婴儿阴茎体，发育得非常小，非常纤细，和婴儿的年龄或者是身高体重并不相匹配，同时可能需要求助于小儿内科医生，或者是儿科、内分泌科医生，来查看婴儿的激素水平，垂体、性腺的功能轴整个的功能；

2、隐匿阴茎：隐匿阴茎的外观可能是非常短小，但是用手去触摸婴儿阴茎体会发现，阴茎体大部分埋藏于皮下，不能从包皮口完全伸出来，这个时候用手推举包皮以后，可以把整个阴茎体暴露出来，可以发现阴茎体正常。针对隐匿阴茎，一般来说，到3-6岁，可以考虑手术矫正，可以把包皮口松弛，包皮口成形，同时把阴茎体周围的筋膜，整个游离清楚、游离干净。游离完毕以后，阴茎根部做固定，同时做包皮口成形，阴囊角成形以后，可能外观上接近或者是和正常一样。

因此婴儿阴茎短小的原因非常多，最主要的是婴儿阴茎真小，就是小阴茎，有的婴儿是假小，是隐匿阴茎。要根据不同的病因，来进行不同的治疗。