摄入辣椒以后肛门疼痛，常见的原因是存在肛门的直肠肛管疾病，常见疾病包括痔疮、肛窦炎、肛裂、肛瘘、肛周脓肿等。如果存在上述疾病，摄入辣的刺激性食物以后，可能加重直肠肛门疾病的发作。例如可能刺激痔核发炎、肛窦炎的炎症增加，导致肛门疼痛。如果存在肛裂，也是同样的道理，可能引起肛门裂口炎症反应。
如果每次摄入辣椒，都出现肛门疼痛，建议至结直肠肛门外科门诊，或者肛肠外科门诊进行肛门检查。通常可以进行肛门镜检查和肛门指诊，判断有无直肠肛门的疾病，如痔疮、肛瘘、肛裂、肛窦炎等。如果存在疾病，根据不同的疾病，给予相应的适当治疗，可以避免以后摄入辣椒再次引起肛门疼痛。
