红斑狼疮的病因以及发病机制目前还不是非常清楚，但在临床研究以及基础研究当中，发现系统性红斑狼疮的病因可以分为两大类原因。
1、遗传相关的原因：一类就是和遗传相关的原因，在部分流行病学还有家族的调查当中发现，如果红斑狼疮患者第一代亲属中有红斑狼疮的病人，亲属的发病率会比一般人群高8倍左右，所以系统性红斑狼疮和遗传因素有关系。另外，在一些易感基因的研究上，也发现某一些基因的遗传可能会导致系统性红斑狼疮的发病率，比其他人群要相应的增加。但并不是某一个单一基因的遗传疾病，而是与多基因相关的疾病；
2、环境因素：另外一大类病因就是环境因素，这种环境因素和比如紫外线的照射、一些病毒的感染以及雌激素的水平都有密切关系。所以红斑狼疮患者在这些病因的作用下，由于机体的免疫异常，导致了机体出现系统性红斑狼疮的自身抗体以及临床表现的出现。
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