卵巢囊肿手术是否影响生育，取决于根据囊肿良性或者恶性的性质，以及个人的具体情况。病理性的囊肿分为良性、恶性或者交界性，常见于以下情况：
1、良性囊肿：对于有生育要求的人，可采取囊肿剥除，保留卵巢，即囊肿剥除术。囊肿剥除术会留下正常的卵巢组织，基本上对生育没有较大的影响。巧克力囊肿患者，由于本身疾病，以及盆腔炎症的环境难以怀孕，手术可改善环境，有利于怀孕；
2、交界性和恶性囊肿：如果是交界性的囊肿，对于有生育要求的人，可以保留健侧病的卵巢和子宫，术后可以生育。对恶性的卵巢囊肿，某些条件下可以保留生育功能，但在特定条件下恶性的卵巢囊肿，不能保留生育功能；
3、其它囊肿：比如畸胎瘤、浆液性和黏液性囊肿，卵巢需要一定的恢复，建议2-3个月后怀孕。如果卵巢的基本功能没有太大破坏，不会影响怀孕、生育。
